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App Pro-02 定量蛋白质组学


定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量,可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。 常用的技术包括:iTRAQ与Label-free。可依据样本蛋白质组定量结果通过统计学进行差异表达分析。

iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术是由AB SCIEX公司研发的一种体外同重同位素标记的相对与绝对定量技术。该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,经高精度质谱仪串联分析,可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量,是近年来定量蛋白质组学常用的高通量筛选技术。

Label-free:无标签标记的定量蛋白质组学研究,依赖于繁杂的信息分析完成定量过程,主要有两种:信号强度和谱图计数法[1]。前者根据一级质谱相关的肽段峰强度(Mass spectral peak intensity)、峰面积(Peak area)、液相色谱保留时间(LC retention time)等信息进行定量分析;后者根据二级质谱相关的每个蛋白鉴定到的肽段总次数(Peptide hide或Spectral counts)、所鉴定肽段的离子价位(Ion counts of identified peptides)等信息进行定量分析。


蛋白芯片, 定量蛋白质组学, iTRAQ,Label-free


Abiocenter具有蛋白质组数据丰富的分析处理经验。分析内容涉及:原始数据蛋白鉴定分析,蛋白修饰分析,蛋白质结构域分析,蛋白质相互作用分析,蛋白质结构建模分析,采用分子动力学模型预测蛋白-蛋白对接与蛋白-配体对接及其结合位点等。

蛋白质组是对蛋白质特别是其结构和功能的大规模研究。蛋白质组学比基因组学要复杂得多。基因组是相当稳定的实体,而蛋白质组通过与基因组的相互作用而不断发生着改变。一个生命体在其机体的不同部分以及生命周期的不同阶段,其蛋白表达可能存在巨大的差异。

常用的定量蛋白组学技术有:iTRAQ技术,LC-MS/MS技术等。


iTRAQ技术,LC-MS/MS技术


质谱平台


LC-MS/MS质谱平台


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